Eerste Heelgenoom-gebaseerde Naspeurbaarheidsanalise van Brucella abortus in Zhejiang Provinsie – Bioinformatika-span van Macro & Micro-Test dra by tot Gesamentlike Publikasie

—— Samewerkende studie deur Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, en China CDC Gepubliseer in Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Studie-oorsig

In Mei 2026 het Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) 'n artikel gepubliseer onder leiding van die Zhejiang Provinsiale Sentrum vir Siektebeheer en -voorkoming (Zhejiang CDC), met die bioinformatika-span van Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. en die Nasionale Instituut vir Oordraagbare Siektebeheer en -voorkoming (China CDC) as mede-outeurs. Die studie is getiteld:
"Identifikasie en filogenetiese analise van sewe Brucella abortus-stamme in Zhejiang, China."
Brucella abortus

Hierdie studie verteenwoordig die eerste sistematiese, filogenetiese naspeurbaarheidsanalise van Brucella abortus (B. abortus) gebaseer op die hele genoom in die Zhejiang-provinsie, China. Die span het sewe isolate geanaliseer wat tussen 2015 en 2025 versamel is (vier stamme van menslike oorsprong en drie stamme van beesoorsprong van Jinhua, Quzhou en Ningbo). Die bevindinge verskaf genomiese bewyse vir die oorsprong en oordragroetes van hierdie "noordelike dominante spesie" in 'n atipiese suidelike epidemiese streek van oostelike China.

 

Agtergrond en Betekenis

 

Brucellose is 'n soönotiese siekte wat veroorsaak word deur bakterieë van die genus Brucella. Brucella abortus infekteer hoofsaaklik beeste, maar kan ook siektes by mense veroorsaak. In China toon brucellose merkbare geografiese variasie: die hoogste voorkoms kom voor in noordelike provinsies (bv. Binne-Mongolië, Shanxi, Heilongjiang). In teenstelling hiermee is suidelike provinsies, insluitend Zhejiang, histories oorheers deur Brucella melitensis, met baie min aangemelde gevalle van B. abortus. Hierdie streeksverskil maak die genetiese karakterisering en bronopsporing van B. abortus in Zhejiang 'n belangrike openbare gesondheidsprioriteit.

 

Metodes en belangrike bevindinge

Die navorsingspan het 'n veelsydige strategie aangeneem wat molekulêre biologie en bioinformatika kombineer:

1.Patogeenidentifikasie en basiese tipering

BCSP-31 geen PCR en AMOS-PCR het bevestig dat al sewe isolate B. abortus was.

Multilokus-volgorde-tipering (MLST) gebaseer op nege huishoudingsgene het aan die lig gebring dat alle isolate aan volgordetipe ST2 behoort het, wat dui op hoë genetiese homogeniteit onder die sirkulerende B. abortus-stamme in Zhejiang.
Patogeenidentifikasie en basiese tipering

2.Karakterisering van die hele genoom

Heelgenoomvolgordebepaling is op die Illumina NovaSeq-platform uitgevoer. Gemiddelde nukleotiedidentiteit (ANI)-analise het getoon dat die Zhejiang-isolate tot 99.99% ooreenkoms met die verwysingsstam B. abortus 544 gedeel het.

Pan-genoom-analise het 'n hoogs gekonserveerde populasie aan die lig gebring: 3 084 kerngene is geïdentifiseer, tesame met slegs 10 dopgene, en geen sagtekern- of wolkgene is opgespoor nie.

prent 1

 

3.Virulensie- en antimikrobiese weerstandsgeenprofiele

'n Totaal van 68 virulensie-verwante faktore is voorspel, wat klassieke weë soos LPS-biosintese, die T4SS-sekresiestelsel en die BvrR-BvrS tweekomponent-regulatoriese stelsel dek. Dit is opmerklik dat alle isolate die adhesiengene bmaA en btaF kortgekom het. Weerstandsgeenanalise het slegs die mprF-geen in die CARD-databasis opgespoor, met geen ander weerstandsdeterminante wat geïdentifiseer is nie.

Virulensie4. Filogenetiese rekonstruksie en oordragopsporing

Kern-genoom enkel-nukleotied polimorfisme (cgSNP) analise het die Zhejiang isolate op 'n spesifieke posisie in die globale filogenetiese boom geplaas. Die resultate het getoon dat die Zhejiang-stamme 'n monofiletiese groep vorm saam met stamme van Rusland, Mongolië en verskeie noordelike Chinese provinsies (Ningxia, Heilongjiang, Binne-Mongolië, Hebei, Gansu, Beijing). Hierdie groep verdeel verder in drie afsonderlike subklades (Klade 1-3), wat dui op verskeie onafhanklike bekendstellingsgebeurtenisse.

Filogenetiese rekonstruksie

Gevolgtrekkings en Implikasies

 

Hierdie studie verskaf die eerste hoë-presisie genomiese datastel van B. abortus in die Zhejiang Provinsie en lewer verskeie belangrike gevolgtrekkings:

 

  1. Clear genetiese agtergrond– Die B. abortus-stamme wat in Zhejiang sirkuleer, behoort aan ST2, is genomies hoogs bewaar en verteenwoordig 'n tipiese beesbrucellose-afkoms.

 

2. Evidense van kruisstreekse oordrag– Filogenetiese analise ondersteun nie die bestaan ​​van 'n onafhanklike endemiese afstamming in Zhejiang nie. In plaas daarvan dui die data sterk daarop dat hierdie stamme uit Noord-China ontstaan ​​het en moontlik 'n gemeenskaplike evolusionêre agtergrond met stamme uit Rusland en Mongolië deel. Die teenwoordigheid van drie subklades impliseer veelvuldige afsonderlike bekendstellingsgebeurtenisse.

 

3. Implikasies vir openbare gesondheid– Die bevindinge beklemtoon die waarde van genomiese toesig vir brucellose, selfs in tradisioneel nie-endemiese streke soos Zhejiang. Alhoewel die huidige gevalletelling laag is, kan hoëresolusie-instrumente soos cgSNP die bron van ingevoerde uitbrake effektief opspoor en wetenskaplike bewyse verskaf om oordragkettings wat verband hou met interprovinsiale veevervoer te onderbreek.

 

Hierdie werk vul nie net 'n navorsingsgaping in die Zhejiang-provinsie nie, maar verskaf ook nuwe basislyndata vir patogeenmonitering en risikobepaling van brucellose in die Yangtze-rivierdelta-streek.

 

Papierinligting:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Identifikasie en filogenetiese analise van sewe Brucella abortus-stamme in Zhejiang, China. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Plasingstyd: 10 Junie 2026