'n Onlangse metagenomiese studie het 'n merkwaardig diverse spektrum virusse en bakterieë aan die lig gebring wat deur knaagdiere in die Heilongjiang-provinsie gedra word, insluitend die Lassa-virus, Amur-virus, Salmonella en Yersinia pestis.
Die navorsing het gebruik gemaak van diePatogeen RNA Verrykingskit van Macro & Micro-Test, gebaseer op probe-opvangtegnologie. Deur gasheer-rRNA en ander gekonserveerde gasheerfragmente selektief uit te put, het die metode mikrobiese RNA effektief behou, wat die sensitiwiteit van patogeenopsporing aansienlik verbeter het. Hierdie patogeen-RNA-verrykingstap was van kritieke belang om 'n hoë opsporingskoers te bereik en het sterk tegniese ondersteuning vir patogeenmonitering gebied.
Knaagdiere: Belangrike reservoirs van soönotiese siektes
Knaagdiere is die mees spesieryke en wydverspreide groep soogdiere, wat meer as 2 000 spesies wêreldwyd uitmaak en meer as 40% van alle soogdierspesies uitmaak.
Benewens hul ekologiese belangrikheid, dien knaagdiere as belangrike reservoirs en vektore van talle soönotiese patogene.Omdat knaagdierhabitatte gereeld met menslike omgewings oorvleuel – deur direkte byte, kontak met uitskeidings of indirekte oordrag via vlooie en myte – hou die patogene wat hulle huisves volgehoue bedreigings vir die openbare gesondheid in.
Dit is veral belangrik dat meer as 70% van opkomende aansteeklike siektes van wildlewe afkomstig is, met knaagdiere wat een van die belangrikste virale reservoirs verteenwoordig.
Heilongjiang-grensstreek: 'n Frontlinie vir patogeenmonitering
Heilongjiang, 'n grensprovinsie in noordoos-China, beskik oor oorvloedige ekologiese hulpbronne en deel grense met verskeie lande. Die kombinasie van ryk biodiversiteit en gereelde grensoverschrijdende bevolkingsbewegings skep gunstige toestande vir die oordrag van patogene.
Tussen Junie en Julie 2021 het navorsers 67 wilde knaagdiere van Hengdaohezi Town, Mudanjiang City, versamel. Die monsters het ingesluit:
l20Apodemus-skiereiland
l47Myodes rufocanus
Alle monsters is in residensiële gebiede en omliggende landbougrond vasgelê, wat die noue raakvlak tussen menslike nedersettings en wildlewe-habitatte beklemtoon.
Patogeenverrykingstegnologie: Oorkoming van gasheeragtergrondinterferensie
In metagenomiese volgordebepaling domineer gasheer-RNA tipies volgordebepalingslesings, wat lae-oorvloed patogeenseine masker.
Om hierdie uitdaging aan te spreek, het die studie gebruik gemaakMakro- en Mikro-toets se patogeen-metagenomiese opsporingstel. Deur gebruik te maak van probe-vangstegnologie bind spesifiek ontwerpte probes aan gasheer-rRNA en gekonserveerde volgordes, wat hul uitputting moontlik maak en sodoende mikrobiese RNA verryk.
Hierdie benadering het die sensitiwiteit van patogeenopsporing aansienlik verbeter, wat die volgordebepaling van die stroomaf moontlik gemaak het om 'n hoër proporsie patogeenlesings te herwin. Die verrykingstap het 'n stewige fondament gelê vir die akkurate karakterisering van die patogeenspektrum wat deur knaagdiere gedra word.
Na verryking het RNS-monsters omgekeerde transkripsie, biblioteekkonstruksie en hoë-deurset-volgordebepaling ondergaan. Bioinformatiese analise het ingesluit:
l Gasheergenoomfiltrering
Taksonomiese klassifikasie met behulp van Kraken2
l Oorvloedkorreksie met Bracken
Hierdie werkvloei het 'n omvattende profiel van virale en bakteriese gemeenskappe gegenereer.
Navorsingsbevindinge: Ko-sirkulasie van veelvuldige virusse en bakterieë
Virale Bevindinge
Die opgespoorde virusse het aan 21 virusfamilies behoort, insluitendArenaviridaeenHantaviridae.
Deurvan nuuts afSamestelling met behulp van Megahit, is 154 virale contigs gegenereer, waarvan 110 met 19 virusse van agt families in lyn gebring het.
In Apodemus-skiereiland, is die volgende virusse geïdentifiseer:
l Arenavirusse: Lassa-virus, Wenzhou-virus, Gairo-virus
l Hantavirusse: Amur-virus, Puumala-virus
In Myodes rufocanus, Rot-arterivirus en Amur-virus is opgespoor.
Onder hierdie patogene:
Die Lassa-virus is 'n veroorsakende agent van virale hemorragiese koors, met sterftesyfers van ongeveer 20%.
Die Amoer-virus is een van die patogene wat verantwoordelik is vir hemorragiese koors met niersindroom (HFRS). China rapporteer die hoogste wêreldwye las van hantavirusinfeksies.
Bakteriële Bevindinge
'n Totaal van 1 051 bakteriese genera is geannoteer.
Die volopste genera was:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellais 'n belangrike voedselgedraagde patogeen, verantwoordelik vir 'n geraamde 9 miljoen gevalle van tifuskoors en ongeveer 110 000 sterftes jaarliks wêreldwyd.
Yersinia pestis, die veroorsakende agent van pes, was verantwoordelik vir drie historiese pandemies. Heilongjiang-provinsie word erken as een van China se natuurlike plaagfokuspunte en bly 'n prioriteitsstreek vir plaagmonitering.
Betekenis van die Studie
Wetenskaplike Bydraes
Hierdie studie verteenwoordig die eerste verslag van Lassa-virusfragmente en rotarteritisvirus in knaagdiere van Heilongjiang, wat China se knaagdiergedraagde patogeendatabasis uitbrei.
Dit karakteriseer sistematies virale en bakteriese gemeenskappe in plaaslike knaagdierbevolkings en verskaf basislyndata vir soönotiese siektemonitering in grensstreke.
Implikasies vir openbare gesondheid
Die bevindinge beklemtoon die behoefte aan deurlopende toesig en patogeen-sifting vanA. peninsulaeenM. rufocanus.
Die data verskaf wetenskaplike bewyse wat bronbeheerstrategieë vir siektes soos pes en hemorragiese koors met niersindroom ondersteun.
Metodologiese Sterkpunte
Metagenomiese volgordebepaling maak onbevooroordeelde opsporing van beide bekende en nuwe patogene moontlik.
In hierdie studie het Macro & Micro-Test se patogeenverrykingstegnologie sterk werkverrigting getoon, wat die opsporing van teikenpatogeen in komplekse biologiese monsters effektief verbeter het. Die resultate bevestig die vermoë daarvan om hoësensitiewe patogeenidentifikasie in wildbewaking te ondersteun.
Produk Aanbeveling
Gebaseer op die suksesvolle toepassing daarvan in hierdie studie, word die Makro- en Mikrotoets-patogeen-RNA-verrykingskit sterk aanbeveel vir metagenomiese toesignavorsing.
Deur die doeltreffende uitputting van gasheernukleïensure en die verryking van mikrobiese volgordes, verbeter die stel die sensitiwiteit van opsporing en datakwaliteit aansienlik. Dit verteenwoordig 'n noodsaaklike instrument vir akkurate patogeenontdekking in komplekse monsters en bied robuuste tegniese ondersteuning vir openbare gesondheidsmonitering, soönotiese risikobepaling en uitbraaikvoorbereiding.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Plasingstyd: 2 Maart 2026